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科學(xué)算命來(lái)臨!全基因分析成功預測5種常見(jiàn)病發(fā)病風(fēng)險,科學(xué)家太給力了

2018-09-11 來(lái)源:奇點(diǎn)網(wǎng)  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:說(shuō)起基因和疾病,奇點(diǎn)糕首先想到的就是高中生物課里學(xué)的各種紅綠色盲、血友病、白化病等等遺傳病。這些遺傳病有個(gè)共同特點(diǎn),都是單基因遺傳,也就是它們的發(fā)病都只和一個(gè)基因的異常有關(guān),測一個(gè)基因就能知道會(huì )不會(huì )得病了。

算命這件事可謂歷史悠久,從商代的占卜,到文王拘而演周易,一直延續到世紀初打著(zhù)高科技名義坑蒙拐騙的“電腦算命”。

不過(guò)像奇點(diǎn)糕這樣,接受了馬克思主義教育的共產(chǎn)主義接班人,自然是不會(huì )相信這些封建迷信的。“算命”最大的意義恐怕就是給我們留下了商代的甲骨文,讓我們可以一窺4000年前祖先的生活。

不過(guò)現在,這一封建迷信的傳統領(lǐng)域也部分地被科學(xué)攻克了。近日,哈佛醫學(xué)院的AmitKhera和SekarKathiresan等,通過(guò)全基因組評分,成功預測了冠心病、房顫、2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌這5種疾病的發(fā)病風(fēng)險[1]。文章發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上。

說(shuō)起基因和疾病,奇點(diǎn)糕首先想到的就是高中生物課里學(xué)的各種紅綠色盲、血友病、白化病等等遺傳病。這些遺傳病有個(gè)共同特點(diǎn),都是單基因遺傳,也就是它們的發(fā)病都只和一個(gè)基因的異常有關(guān),測一個(gè)基因就能知道會(huì )不會(huì )得病了。

不過(guò),大多數的疾病都是多個(gè)基因,再加上環(huán)境因素共同作用的造成的。比如在帕金森中,最常見(jiàn)的LRRK2突變也只占了全部發(fā)病人數的3%[2]。在2型糖尿病中,最常見(jiàn)的HNF1α突變也只能解釋2.1%的患者[3]。

而像冠心病,流行病學(xué)調查顯示40-60%的易感性是遺傳因素帶來(lái)的[4],全基因組關(guān)聯(lián)性也發(fā)現了33個(gè)和冠心病有關(guān)的基因,每個(gè)基因突變都會(huì )不同程度地增加冠心病的風(fēng)險[5]。比如,遺傳性高膽固醇血癥突變,一種出現率0.4%的突變,會(huì )使冠心病的風(fēng)險增加3倍[6]。

影響因素這么復雜,研究起來(lái)自然很難。不過(guò)還好,測序技術(shù)和計算機技術(shù)的成熟,使得獲得和處理大量樣本成為可能,也讓對多基因遺傳病的預測研究可以開(kāi)展。

“我們很久以前就知道,整體基因變異情況是一些疾病的高危因素”通訊作者SekarKathiresan說(shuō),“現在,我們能夠使用基因組數據來(lái)衡量這種風(fēng)險。從公共衛生的角度來(lái)看,我們需要確定這些高危人群,以便提供適當的預防措施。”

在2006年,威康信托醫療慈善機構、醫學(xué)研究理事會(huì )、衛生部、蘇格蘭政府和西北地區發(fā)展署共同建立了英國生物銀行。在2006到2010年間,英國生物銀行一共招募了50萬(wàn)名年齡在40至69歲之間的志愿者,收集了血液、尿液和唾液樣本,并在之后跟蹤他們的健康狀況。

這些數據正好可以用于多基因遺傳病的研究。

AmitKhera等首先根據以往的數據,為冠心病建立了31個(gè)全基因組多基因評分(GPS)模型,然后從英國生物銀行中抽取120280名志愿者的數據,對這些模型進(jìn)行了測試。

研究人員對評分和發(fā)病率作圖,根據曲線(xiàn)下面積(AUC)對這些模型進(jìn)行評價(jià),選取出最好的一個(gè)模型,再用英國生物銀行中,另外抽取288978名志愿者的數據對其進(jìn)行驗證。

在驗證隊列中,通過(guò)這個(gè)多基因評分模型,研究人員發(fā)現有8%的人患冠心病的風(fēng)險比普通人高3倍多,是之前根據遺傳性高膽固醇血癥這一個(gè)基因突變找出的高危人群的20倍。而比普通人冠心病風(fēng)險高4倍和5倍的分別有2.3%和0.5%。

“對于心臟病發(fā)作,我預測每個(gè)病人在不久的將來(lái)都有機會(huì )知道自己的多基因風(fēng)險指數——就像他們現在知道自己的膽固醇指數一樣。”通訊作者Kathiresan博士表示。

接下來(lái),研究人員又用同樣的方法對房顫、2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌進(jìn)行了分析。

對于房顫,多基因預報模型發(fā)現有6.1%的人有3倍風(fēng)險,而評分最高的1%的人有4.63倍的風(fēng)險。至于2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌,分別有3.5%、3.2%和1.5%的人有3倍風(fēng)險。

當然,光找出易感人群是不夠的,還要有針對性的預防措施。比如冠心病,課題組之前的研究顯示,通過(guò)健康的生活方式,以及服用他汀類(lèi)藥物降低血脂,是可以抵消掉基因帶來(lái)的冠心病風(fēng)險的[7-9]。

Kathiresan博士說(shuō):“我們將多基因風(fēng)險評分作為一種方法,在出生時(shí)識別出疾病的高風(fēng)險或低風(fēng)險人群,然后使用這些信息來(lái)針對性干預,無(wú)論是通過(guò)生活方式的改變還是治療。”

不過(guò)研究人員也指出,他們的研究是基于歐洲人的,如果用于其他人群,可能還需要做進(jìn)一步的驗證。此外,這樣的基因檢測會(huì )不會(huì )造成“基因歧視”也是個(gè)值得思考的問(wèn)題。

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