腸侵襲性大腸埃希桿菌感染在多數情況下屬于自限性疾病，多于1～2周內痊愈。預后和下列因素有關(guān)：
①年老體弱、嬰幼兒及免疫功能低下患者，并發(fā)癥多，預后嚴重;
②中毒性菌痢病死率較高，尤其是呼吸衰竭型;
③痢疾志賀菌Ⅰ型引起癥狀較為嚴重，而福氏菌易致慢性，耐藥性菌株則影響療效;
④采用適當抗菌藥物對清除感染有重要作用。用藥不當、療程不足、治療不及時(shí)均影響療效。