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小兒孤獨癥尚不清楚，可能與以下因素有關(guān)：1、遺傳。遺傳因素對孤獨癥的作用已趨于明確，但具體的遺傳方式還不明了。2、圍生期因素。圍生期各種并發(fā)癥，如產(chǎn)傷、宮內窒息等較正常對照組多。3、免疫系統異常發(fā)現T淋巴細胞數量減少，輔助T細胞和B細胞數量減少、抑制-誘導T細胞缺乏、自然殺傷細胞活性減低等。4、神經(jīng)內分泌和神經(jīng)遞質(zhì)。與多種神經(jīng)內分泌和神經(jīng)遞質(zhì)功能失調有關(guān)。研究發(fā)現孤獨癥患者的單胺系統，如5-羥色胺（5-HT）和兒茶酚胺發(fā)育不成熟，松果體-丘腦下部-垂體-腎上腺軸異常，導致5-HT、內啡肽增加，促腎上腺皮質(zhì)激素（ACTH）分泌減少。